Desde el lanzamiento de la plataforma de pirosecuenciación 454 FLX en 2005 por 454 Life Sciences (adquirida formalmente por Roche en 2007), su serie de productos estrella de secuenciadores de electroforesis de matriz capilar se ha topado con dos fuertes competidores. Una vez lanzaron el analizador de ADN 3730xl. de Applied Biosystems (ABI), que durante mucho tiempo tuvo la mayor participación en el mercado de secuenciación, está comenzando a flaquear. Uno es el secuenciador 454 de Roche. La otra es la plataforma analizadora del genoma Solexa lanzada por la empresa estadounidense Illumina en 2006. Con este fin, ABI lanzó su propio secuenciador de estado sólido en 2007. Estas tres plataformas de secuenciación son representantes de las plataformas de secuenciación de alto rendimiento actuales. (Ver Tabla 1) Nombre de la empresa, principios técnicos, modelo de negocio de los desarrolladores de tecnología, métodos de secuenciación de ADN y clonación paralela masiva basados en cuentas magnéticas de Apply Biosystems (ABI). Agencourt Private Genomics Company (APG) Empresa cotizada en EE. UU.: vende equipos y reactivos. Beneficios de el método de secuenciación sintética Illumina David Bentley, científico jefe de la empresa británica Solexa, que cotiza en bolsa: beneficio de la venta de equipos y reactivos El ensayo de síntesis masivamente paralela de pirofosfato de Roche Jonathan Rothberg, fundador de la estadounidense 454 Life Sciences Company ) enumera una empresa que : vende equipos y reactivos con fines de lucro. Este producto fue descontinuado en 2013. Método de secuenciación masivamente paralela de síntesis de una sola molécula de Helicos Stephen Quake, bioingeniero de la Universidad de Stanford, EE. UU., listado: Oferta pública inicial (IPO) de mayo de 2007 (P.D. Debido a la baja precisión de la plataforma, la compañía se declaró en quiebra en 2012) Complete Genomics DNA Nano Array y métodos de secuenciación de ligadura de anclaje de sonda combinatoria radoje drmanac Empresa privada, científico jefe de Complete Genomics en los Estados Unidos: inversión de 46,5 millones de dólares estadounidenses, la empresa fue adquirida por BGI en 2065438 Tabla 1: Descripción general de las principales plataformas de secuenciación
Roche 454 Pyrosequencing
(Pyrosequencing)
Illumina Solexa Sequencing by Synthesis
(Sequencing by Synthesis)
Análisis del genoma de Illumina El principio de secuenciación del instrumento
Los secuenciadores de próxima generación Hiseq 2000 y Hiseq 2500 de Illumina tienen ventajas sobresalientes como alta precisión, alta capacidad de rendimiento, alta sensibilidad y bajos costos operativos. Pueden completar la investigación genómica tradicional (secuenciación y anotación). ) al mismo tiempo ) y la investigación en genómica funcional (expresión y regulación genética, función genética, interacciones proteína/ácido nucleico). Hiseq es una tecnología de secuenciación basada en grupos de una sola molécula que se basa en el principio de terminación reversible de reacciones químicas. Durante el proceso de secuenciación, se unen fragmentos aleatorios de ADN genómico a una superficie de vidrio ópticamente transparente (es decir, la celda de flujo). Después de la extensión y la amplificación puente, se forman miles de millones de grupos en las células que fluyen, cada uno de los cuales es un grupo de moléculas individuales con miles de copias de la misma plantilla. Luego, se utilizan cuatro desoxinucleótidos especiales con grupos fluorescentes y tecnología SBS (secuenciación por síntesis) de terminación reversible para secuenciar el ADN plantilla que se va a analizar.
Secuenciación de ligadura sólida ABI
(mediante secuencia ligada)